Berikut adalah Program Lembaga Tahsin dan Tahfizh Al-Qur'an. LPM STID Mohammad Natsir
1. Tahsin Tilawah Al-Qur’an (Dewasa-Lansia)
2. Tahsin Tilawah Al-Qur’an Khusus Remaja (SMP-SMA)
3. Tahfizh Al-Qur’an 30 Juz (Remaja, Dewasa-Lansia)
4. Tahfizh Lil Aulad (Usia TK-SD)
5. Talaqqy Al-Qur’an
6. Nagham Tilawah Al-Qur’an
7. Layanan Tadarus Al-Qur’an Via Telephon
8. Pelatihan-pelatihan (Daurah)
- Daurah Pengajaran Al-Qur’an Metode Iqra
- Daurah Al-Waqfu wal Ibtida’
- Daurah Tahfizh Al-Qur’an
- Daurah Metode Mengajar Tahfizh Al-Qur’an Lil Aulad
- Daurah Tarjamah Al-Qur’an untuk Anak-anak
- Pelatihan Imam
- Pelatihan Membaca Al-Qur’an Irama Rass
- Daurah Qira’ah Sab’ah
- Pelatihan Mengajar Metode BCM (Bermain, Cerita dan Menyanyi)
- Daurah Ilmu tajwid
10. Kaderisasi dan Pembinaan Guru Al-Qur’an
11. Pelayanan Perpustakaan (Laboratorium) Al-Qur’an
12. Penerbitan CD Al-Qur’an
13. Studi Banding ke Pesantren Al-Qur’an
14. Wisuda Al-Qur’an